Een nieuwe methode om bomen met gewenste eigenschappen te vinden
De tool “4TREE” is ontwikkeld om genomische informatie te genereren die kan worden gebruikt om bomen met gewenste eigenschappen te selecteren. De tool is gemaakt voor vier belangrijke bosboomsoorten in Europa: Pinus maritima, Pinus pinea, Fraxinus excelsior en Populus spp.
Plant Breeding en het Centrum voor Genetische Bronnen Nederland (CGN) van Wageningen University & Research, hebben zich, samen met het Franse instituut INRAE, op es (Fraxinus excelsior) gericht.
DNA - merkers
De tool is gebaseerd op SNP’s (Single Nucleotide Polymorphisms): DNA-merkers waarmee verschillen in het DNA van individuen binnen een soort kunnen worden opgespoord.
Onderzoekers ontwikkelden een zogeheten SNP-array, een kleine chip, waarop meer dan 12,000 SNP-merkers voor essen zitten. Een deel van de merkers is gelijkmatig verdeeld over het genoom om genetische verschillen tussen individuen op te sporen. Daarnaast is een aantal markers opgenomen voor DNA dat mogelijk gelinkt is aan interessante eigenschappen voor veredelaars.
Opsporen van resistente essen
Een van de gewenste eigenschappen is resistentie tegen de essentaksterfte. Veel essen worden bedreigd door deze schimmelziekte, maar niet alle essen zijn even gevoelig voor de ziekte. De oorzaak hiervan lijkt genetisch te zijn.
Zowel CGN als INRAE hebben nu veldproeven met essenpopulaties en nakomelingen, die mogelijk tolerant zijn voor de ziekte, maar waarvan de genetische basis nog niet is vastgesteld. De tool wordt nu getest op 2000 essen die verzameld zijn door middel van proeven in Nederland en Frankrijk, met als doel het vinden van resistente essen.
De genotyperingstool 4TREE voor essen wordt op termijn beschikbaar gesteld om te gebruiken in veredelingsprogramma’s van essen.
Meer informatie over het B4estproject: www.b4est.eu